Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa-rs1P17533 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa-rs1P17533 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa-rs1P17533 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms