Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q9P14431 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q9P14431 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q9P14431 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q9P14431 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-Q9P14431 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-Q9P14431 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q9P14431 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q9P14431 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q9P14431 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q9P14431 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q9P14431 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q9P14431 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q9P14431 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q9P14431 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q9P14431 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q9P14431 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Q9P14431 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Q9P14431 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms