Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrm1P12657 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrm1P12657 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrm1P12657 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms