Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcp1P11983 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tcp1P11983 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcp1P11983 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcp1P11983 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcp1P11983 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcp1P11983 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcp1P11983 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcp1P11983 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcp1P11983 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcp1P11983 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcp1P11983 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms