Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NclP09405 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NclP09405 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NclP09405 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NclP09405 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NclP09405 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NclP09405 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NclP09405 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NclP09405 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NclP09405 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NclP09405 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NclP09405 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NclP09405 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NclP09405 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NclP09405 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NclP09405 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NclP09405 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NclP09405 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NclP09405 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NclP09405 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NclP09405 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NclP09405 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NclP09405 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NclP09405 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NclP09405 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NclP09405 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
NclP09405 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NclP09405 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NclP09405 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
NclP09405 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NclP09405 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NclP09405 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NclP09405 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NclP09405 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NclP09405 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NclP09405 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NclP09405 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NclP09405 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NclP09405 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NclP09405 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NclP09405 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NclP09405 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NclP09405 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NclP09405 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NclP09405 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NclP09405 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NclP09405 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NclP09405 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NclP09405 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NclP09405 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NclP09405 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NclP09405 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NclP09405 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NclP09405 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NclP09405 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NclP09405 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NclP09405 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NclP09405 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NclP09405 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NclP09405 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NclP09405 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NclP09405 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NclP09405 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NclP09405 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NclP09405 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NclP09405 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NclP09405 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NclP09405 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NclP09405 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NclP09405 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NclP09405 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NclP09405 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NclP09405 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
NclP09405 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NclP09405 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NclP09405 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NclP09405 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NclP09405 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NclP09405 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NclP09405 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NclP09405 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NclP09405 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
NclP09405 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NclP09405 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33■■■□□ 2.87
NclP09405 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NclP09405 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NclP09405 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NclP09405 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NclP09405 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NclP09405 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NclP09405 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NclP09405 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NclP09405 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NclP09405 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NclP09405 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NclP09405 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NclP09405 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NclP09405 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NclP09405 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NclP09405 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms