Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa5P09021 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa5P09021 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxa5P09021 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms