Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gap43P06837 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gap43P06837 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gap43P06837 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gap43P06837 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gap43P06837 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gap43P06837 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gap43P06837 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gap43P06837 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gap43P06837 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gap43P06837 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gap43P06837 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gap43P06837 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gap43P06837 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gap43P06837 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms