Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B2mP01887 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
B2mP01887 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
B2mP01887 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B2mP01887 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B2mP01887 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B2mP01887 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B2mP01887 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B2mP01887 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B2mP01887 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B2mP01887 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B2mP01887 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
B2mP01887 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B2mP01887 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B2mP01887 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B2mP01887 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B2mP01887 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B2mP01887 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B2mP01887 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B2mP01887 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B2mP01887 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B2mP01887 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B2mP01887 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B2mP01887 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B2mP01887 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B2mP01887 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
B2mP01887 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B2mP01887 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B2mP01887 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B2mP01887 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B2mP01887 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B2mP01887 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B2mP01887 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B2mP01887 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B2mP01887 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B2mP01887 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B2mP01887 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B2mP01887 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B2mP01887 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B2mP01887 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B2mP01887 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B2mP01887 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B2mP01887 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B2mP01887 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
B2mP01887 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
B2mP01887 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B2mP01887 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B2mP01887 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B2mP01887 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B2mP01887 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B2mP01887 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B2mP01887 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B2mP01887 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B2mP01887 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
B2mP01887 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B2mP01887 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B2mP01887 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B2mP01887 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B2mP01887 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B2mP01887 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B2mP01887 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B2mP01887 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B2mP01887 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B2mP01887 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B2mP01887 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B2mP01887 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B2mP01887 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B2mP01887 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B2mP01887 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B2mP01887 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B2mP01887 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B2mP01887 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B2mP01887 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B2mP01887 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B2mP01887 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B2mP01887 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B2mP01887 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B2mP01887 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B2mP01887 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B2mP01887 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B2mP01887 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B2mP01887 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
B2mP01887 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B2mP01887 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B2mP01887 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
B2mP01887 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B2mP01887 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
B2mP01887 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B2mP01887 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B2mP01887 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B2mP01887 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B2mP01887 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B2mP01887 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B2mP01887 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B2mP01887 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B2mP01887 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B2mP01887 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B2mP01887 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B2mP01887 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B2mP01887 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms