Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01678 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01678 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01678 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01678 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01678 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01678 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01678 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01678 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01678 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01678 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01678 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01678 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01678 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01678 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01678 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01678 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01678 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01678 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01678 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01678 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01678 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01678 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01678 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01678 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
P01678 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01678 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01678 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01678 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01678 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01678 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01678 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01678 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01678 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01678 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01678 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01678 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01678 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01678 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01678 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01678 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01678 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01678 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01678 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01678 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01678 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01678 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01678 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01678 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01678 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01678 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01678 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01678 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01678 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01678 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01678 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01678 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01678 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01678 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01678 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01678 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
P01678 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01678 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01678 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01678 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01678 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01678 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
P01678 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01678 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01678 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
P01678 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01678 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01678 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01678 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01678 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01678 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
P01678 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01678 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01678 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
P01678 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
P01678 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01678 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01678 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01678 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01678 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01678 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01678 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01678 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01678 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01678 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01678 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01678 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01678 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01678 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
P01678 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
P01678 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01678 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01678 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01678 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
P01678 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms