Protein–RNA interactions for Protein: O89006

Magea1, Magea1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea1O89006 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Magea1O89006 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Magea1O89006 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Magea1O89006 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Magea1O89006 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Magea1O89006 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Magea1O89006 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Magea1O89006 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Magea1O89006 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Magea1O89006 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Magea1O89006 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Magea1O89006 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Magea1O89006 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Magea1O89006 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Magea1O89006 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Magea1O89006 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Magea1O89006 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Magea1O89006 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Magea1O89006 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Magea1O89006 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Magea1O89006 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Magea1O89006 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Magea1O89006 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms