Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nipsnap1O55125 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap1O55125 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap1O55125 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 839.3 ms