Protein–RNA interactions for Protein: O54774

Ap3d1, AP-3 complex subunit delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3d1O54774 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ap3d1O54774 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ap3d1O54774 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3d1O54774 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms