Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cavin1O54724 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cavin1O54724 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cavin1O54724 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cavin1O54724 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms