Protein–RNA interactions for Protein: O08967

Cyth3, Cytohesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth3O08967 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyth3O08967 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyth3O08967 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyth3O08967 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyth3O08967 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms