Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r88L7N1W8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r88L7N1W8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r88L7N1W8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r88L7N1W8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r88L7N1W8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r88L7N1W8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r88L7N1W8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r88L7N1W8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r88L7N1W8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn2r88L7N1W8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r88L7N1W8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r88L7N1W8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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