Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IfnabL7MTU6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IfnabL7MTU6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms