Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm379J3QQ19 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm379J3QQ19 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm379J3QQ19 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm379J3QQ19 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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