Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Calhm3J3QMI4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Calhm3J3QMI4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calhm3J3QMI4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calhm3J3QMI4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms