Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms