Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lipo1J3QME6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lipo1J3QME6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lipo1J3QME6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms