Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem200cJ3QK46 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem200cJ3QK46 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmem200cJ3QK46 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmem200cJ3QK46 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem200cJ3QK46 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem200cJ3QK46 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem200cJ3QK46 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem200cJ3QK46 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem200cJ3QK46 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem200cJ3QK46 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem200cJ3QK46 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem200cJ3QK46 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem200cJ3QK46 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem200cJ3QK46 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem200cJ3QK46 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem200cJ3QK46 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem200cJ3QK46 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms