Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm17535J3KMR8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm17535J3KMR8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm17535J3KMR8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm17535J3KMR8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm17535J3KMR8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm17535J3KMR8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm17535J3KMR8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm17535J3KMR8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm17535J3KMR8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm17535J3KMR8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm17535J3KMR8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm17535J3KMR8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm17535J3KMR8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm17535J3KMR8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm17535J3KMR8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm17535J3KMR8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm17535J3KMR8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm17535J3KMR8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm17535J3KMR8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm17535J3KMR8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm17535J3KMR8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm17535J3KMR8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms