Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chrna9G3X8Z7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrna9G3X8Z7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrna9G3X8Z7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrna9G3X8Z7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms