Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm5218F6YH22 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5218F6YH22 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms