Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm8444F6XS56 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm8444F6XS56 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm8444F6XS56 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8444F6XS56 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms