Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20671F6TVX7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20671F6TVX7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20671F6TVX7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20671F6TVX7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20671F6TVX7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20671F6TVX7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20671F6TVX7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20671F6TVX7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20671F6TVX7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20671F6TVX7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20671F6TVX7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20671F6TVX7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20671F6TVX7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20671F6TVX7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20671F6TVX7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20671F6TVX7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20671F6TVX7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms