Protein–RNA interactions for Protein: F6PZL4

Gm15448, Predicted gene 15448, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15448F6PZL4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm15448F6PZL4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm15448F6PZL4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm15448F6PZL4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm15448F6PZL4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms