Protein–RNA interactions for Protein: E9QAA8

Gm4841, Interferon-gamma-inducible GTPase Ifgga3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4841E9QAA8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm4841E9QAA8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm4841E9QAA8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm4841E9QAA8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm4841E9QAA8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm4841E9QAA8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm4841E9QAA8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm4841E9QAA8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm4841E9QAA8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm4841E9QAA8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm4841E9QAA8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm4841E9QAA8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm4841E9QAA8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm4841E9QAA8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm4841E9QAA8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm4841E9QAA8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm4841E9QAA8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm4841E9QAA8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms