Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nolc1E9Q5C9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nolc1E9Q5C9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nolc1E9Q5C9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nolc1E9Q5C9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nolc1E9Q5C9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.5 ms