Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pde8bE9Q4S1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pde8bE9Q4S1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pde8bE9Q4S1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pde8bE9Q4S1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pde8bE9Q4S1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms