Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2610021A01RikE9Q0Q3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
2610021A01RikE9Q0Q3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms