Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ryr1E9PZQ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ryr1E9PZQ0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ryr1E9PZQ0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ryr1E9PZQ0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms