Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Abca16E9PWJ7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Abca16E9PWJ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abca16E9PWJ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Abca16E9PWJ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Abca16E9PWJ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Abca16E9PWJ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Abca16E9PWJ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Abca16E9PWJ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Abca16E9PWJ7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Abca16E9PWJ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms