Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gimd1E9PW74 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gimd1E9PW74 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gimd1E9PW74 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms