Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm2956E9PVJ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2956E9PVJ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2956E9PVJ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms