Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp839E9PUU5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp839E9PUU5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zfp839E9PUU5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp839E9PUU5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms