Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt2E9PUL5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Prrt2E9PUL5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prrt2E9PUL5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms