Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 922.4 ms