Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lonrf1D3YY23 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lonrf1D3YY23 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lonrf1D3YY23 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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