Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syce3B5KM66 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syce3B5KM66 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syce3B5KM66 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Syce3B5KM66 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Syce3B5KM66 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms