Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap58B2RW38 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap58B2RW38 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap58B2RW38 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap58B2RW38 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap58B2RW38 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap58B2RW38 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap58B2RW38 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap58B2RW38 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfap58B2RW38 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap58B2RW38 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cfap58B2RW38 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms