Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
Abcc8B2RUS7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC46.7■■■■■ 5.07
Abcc8B2RUS7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
Abcc8B2RUS7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC46.69■■■■■ 5.07
Abcc8B2RUS7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.07
Abcc8B2RUS7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC46.69■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC46.69■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC46.68■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC46.67■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC46.66■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC46.64■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
Abcc8B2RUS7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
Abcc8B2RUS7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC46.61■■■■■ 5.05
Abcc8B2RUS7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
Abcc8B2RUS7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
Abcc8B2RUS7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
Abcc8B2RUS7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Abcc8B2RUS7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Abcc8B2RUS7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC46.6■■■■■ 5.05
Abcc8B2RUS7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
Abcc8B2RUS7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
Abcc8B2RUS7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC46.59■■■■■ 5.05
Abcc8B2RUS7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
Abcc8B2RUS7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
Abcc8B2RUS7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Abcc8B2RUS7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC46.53■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC46.52■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.52■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.5■■■■■ 5.04
Abcc8B2RUS7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC46.49■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC46.47■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC46.47■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.45■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
Abcc8B2RUS7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
Abcc8B2RUS7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
Abcc8B2RUS7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
Abcc8B2RUS7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
Abcc8B2RUS7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
Abcc8B2RUS7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
Abcc8B2RUS7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Abcc8B2RUS7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.41■■■■■ 5.02
Abcc8B2RUS7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC46.4■■■■■ 5.02
Abcc8B2RUS7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
Abcc8B2RUS7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
Abcc8B2RUS7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
Abcc8B2RUS7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
Abcc8B2RUS7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC46.38■■■■■ 5.01
Abcc8B2RUS7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC46.37■■■■■ 5.01
Abcc8B2RUS7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
Abcc8B2RUS7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
Abcc8B2RUS7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
Abcc8B2RUS7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC46.33■■■■■ 5.01
Abcc8B2RUS7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Abcc8B2RUS7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Abcc8B2RUS7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC46.32■■■■■ 5.01
Abcc8B2RUS7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Abcc8B2RUS7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC46.3■■■■■ 5
Abcc8B2RUS7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Abcc8B2RUS7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.29■■■■■ 5
Abcc8B2RUS7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC46.28■■■■■ 5
Abcc8B2RUS7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Abcc8B2RUS7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms