Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tbc1d2B1AVH7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d2B1AVH7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tbc1d2B1AVH7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d2B1AVH7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d2B1AVH7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms