Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5640A3KG49 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5640A3KG49 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5640A3KG49 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms