Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931406B18RikA2RSL7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931406B18RikA2RSL7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931406B18RikA2RSL7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms