Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Patl2A2ARM1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Patl2A2ARM1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Patl2A2ARM1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Patl2A2ARM1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms