Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT7

Vmn1r3, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r3A2AMT7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r3A2AMT7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r3A2AMT7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r3A2AMT7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r3A2AMT7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r3A2AMT7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r3A2AMT7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r3A2AMT7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r3A2AMT7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r3A2AMT7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r3A2AMT7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r3A2AMT7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r3A2AMT7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r3A2AMT7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r3A2AMT7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r3A2AMT7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r3A2AMT7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r3A2AMT7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r3A2AMT7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms