Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd4A2AKM2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hacd4A2AKM2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hacd4A2AKM2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hacd4A2AKM2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms