Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc183A2AJB1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc183A2AJB1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc183A2AJB1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc183A2AJB1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms