Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ambra1A2AH22 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ambra1A2AH22 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ambra1A2AH22 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Ambra1A2AH22 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ambra1A2AH22 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ambra1A2AH22 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ambra1A2AH22 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ambra1A2AH22 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ambra1A2AH22 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ambra1A2AH22 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ambra1A2AH22 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ambra1A2AH22 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ambra1A2AH22 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ambra1A2AH22 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ambra1A2AH22 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ambra1A2AH22 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ambra1A2AH22 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ambra1A2AH22 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ambra1A2AH22 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms