Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930447F04RikA2AFR2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930447F04RikA2AFR2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930447F04RikA2AFR2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms